土豆和西红柿基因
土豆（Solanum tuberosum）和西红柿（Solanum lycopersicum）都属于茄科植物，它们在基因组上既有相似性也有差异性。以下是一些关于它们基因的信息：
基因组比较
同源基因对：通过使用Bowtie2和SAMtools软件将reads比对到参考基因组（番茄： SL3.0和马铃薯： PGSC_DM_v4.03），并使用MCScanX软件比较基因组，研究人员发现番茄和马铃薯之间存在816对同源基因对。
染色体比较：在染色体Ⅺ中，番茄有1742个编码基因，而马铃薯有2535个编码基因。
基因组大小
番茄：其基因组大小约为35000个基因，分布在12条染色体上。
马铃薯：其基因组大小尚未完全确定，但研究表明其泛基因组在增加到40个基因组后，得到了接近闭合的泛基因组累积曲线。
基因功能
核心基因：马铃薯泛基因组显示，核心基因通常具有已知功能且广泛高表达。
非核心基因：随着基因组的加入，核心和非核心基因的检出减少。
遗传多样性
番茄：新的番茄图泛基因组中包含36648个蛋白质编码基因，较之前增加了14507个基因。
马铃薯：马铃薯泛基因组在增加到40个基因组后，得到了接近闭合的泛基因组累积曲线，表明这些材料能够代表马铃薯种质的遗传多样性。